ในฐานะมหาวิทยาลัยในกำกับของรัฐ มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี ได้จัดโครงสร้างองค์กรและระบบบริหาร ที่ยึดหลักการกระจายอำนาจ ที่มีลักษณะของการปกครองตนเอง โดยให้การตัดสินใจ วินิจฉัย สั่งการ สิ้นสุดในระดับสภามหาวิทยาลัย ซึ่งเป็นองค์กรบริหารสูงสุดของมหาวิทยาลัย ทั้งนี้เพื่อให้มีความคล่องตัว และมีประสิทธิภาพในการดำเนินงานสูง ในรูปแบบการบริหารในแนวราบ มีการจัดแบ่งส่วนงานที่ชัดเจน ไม่สลับซ้ำซ้อน และวางโครงสร้างการจัดองค์กรวิชาการแบบกลุ่มสหวิทยาการ ที่เอื้อให้มหาวิทยาลัยประยุกต์ใช้นวัตกรรมเชิงบริหารและนวัตกรรมทางการศึกษาได้อย่างมีประสิทธิภาพและมีประสิทธิผล โดยกลไกการกำหนดนโยบาย การวางแผนการควบคุม การติดตามและประเมินผล รวมทั้งการส่งเสริมสนับสนุนกิจการของมหาวิทยาลัย ประกอบด้วยองค์กรสำคัญ ดังนี้ 

• สภามหาวิทยาลัย
• คณะกรรมการประจำสภามหาวิทยาลัย
• สภาวิชาการ
• สำนักงานอธิการบดี
• สำนักวิชา
• สถาบัน – ศูนย์
• หน่วยงานวิสาหกิจ

ทั้งนี้ หน่วยงานทั้งหมดของมหาวิทยาลัยขับเคลื่อนโดย บุคลากรคุณภาพ ที่มีบทบาทสำคัญในทุกระดับของการบริหารและพัฒนา พร้อมเติบโตอย่างภาคภูมิใจภายใต้แนวคิด “Innovate the Future” มุ่งสร้างอนาคตที่ดีร่วมกันอย่างยั่งยืน โดยการดำเนินงานและการพัฒนาบุคลากรของมหาวิทยาลัยยังตั้งอยู่บนพื้นฐานของ SUT PRIDE ที่ถือเป็น ค่านิยมองค์กรของมหาวิทยาลัยเทคโนโลยีสุรนารี (มทส.) ซึ่งย่อมาจาก Professionalism (ความเป็นมืออาชีพ), Relationship (การบริการและการประสานงาน), Integrity (ความซื่อสัตย์และจริยธรรม), Delight (ความสุขในการทำงาน), และ Entrepreneurship (การสร้างคุณค่าและความสำเร็จ) SUT PRIDE จึงเป็นทั้งพลังขับเคลื่อนและแนวทางการปฏิบัติ ที่หล่อหลอมให้บุคลากร มทส. ทุกคน ให้ก้าวไปพร้อมกันในบทบาทของ “ผู้ร่วมสร้างอนาคต” ที่เปี่ยมด้วยคุณภาพ คุณธรรม และความภาคภูมิใจ